دانشگاه یاسوج
دانشکده علوم
گروه شیمی
پایان نامهی کارشناسی ارشد رشتهی شیمی گرایش آلی
مطالعه تئوری بر روی توتومریهای زانتین و بر همکنش این مولکول با آب و یونهای مختلف فلزی در حالت گازی و حلال
استاد راهنما:
دکتر علیرضا سلیمی بنی
استاد مشاور:
دكتر شاپور رمضانی
بهمن ماه 1393
(در فایل دانلودی نام نویسنده موجود است)
تکه هایی از متن پایان نامه به عنوان نمونه :
(ممکن است هنگام انتقال از فایل اصلی به داخل سایت بعضی متون به هم بریزد یا بعضی نمادها و اشکال درج نشود ولی در فایل دانلودی همه چیز مرتب و کامل است)
فهرست مطالب
عنوان صفحه
فصل اول: مقدمه و تاریخچه
1-1- ترکیبات آلی حلقوی…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 1
1-1-1- ترکیبات هتروسیکل……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 1
1-2- پیوند هیدروژنی………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………. 4
1-2-1- جاذبه بین مولکولی و پیوند هیدروژنی……………………………………………………………………………………………………………………………………. 4
1-2-2- نقطه جوش و پیوند هیدروژنی…………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 4
1-2-3- سایر خواص غیر عادی مربوط به پیوند هیدروژن…………………………………………………………………………………………………………….. 4
1-2-4- شرایط تشکیل پیوند هیدروژنی قوی………………………………………………………………………………………………………………………………………. 5
1-2-5- نحوه تشکیل پیوند هیدروژنی…………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 5
1-2-6- شرایط تشکیل پیوند هیدروژنی…………………………………………………………………………………………………………………………………………………. 5
1-3- توتومری و تعریف آن…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 5
1-4- شیمی محاسباتی…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 6
1-4-1- روش های نیمه تجربی……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 8
1-4-2- روش های آغازین……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 8
1-4-3- روش میدان خودسازگار هارتری- فاک………………………………………………………………………………………………………………………………… 9
1-4-4- روش اختلال مولر-پلاست………………………………………………………………………………………………………………………………………………………. 10
1-4-5- روش های نظری تابعیت چگالی15…………………………………………………………………………………………………………………………………………… 10
1-5- مجموعه های پایه………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 12
1-5-1- مجموعه های پایه زتای دوگانه و پایه زتای سه گانه…………………………………………………………………………………………………….. 13
1-5-2- مجموعه پایه قطبیده…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………. 13
1-6- هدف………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 14
فصل دوم: بخش نظری
2-1- روش های محاسباتی………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 16
2-3- فلسفه تئوری Gaussian 09………………………………………………………………………………………………………………………………………………………. 17
2-4- محاسبات در فاز حلال…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 18
فصل سوم: بحث و نتیجه گیری
3-1- مقدمه……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 18
3-2- بحث و نتیجه گیری…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 18
3-2-1- بررسی حالت گازی…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 20
3-3- بررسی پایداری توتومرها در حالت گازی…………………………………………………………………………………………………………………………………… 20
3-4- بررسی ساختار توتومرها در حالت گازی…………………………………………………………………………………………………………………………………… 23
3-5- بررسی پایداری توتومرها در حلال……………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 26
3-6- اثر ویژه حلال……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 28
3-6-1- بررسی پایداری و ساختار………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 28
3-7- بررسی محاسبات NBO و Mulikenدر نه توتومر زانتین با بهره گرفتن از روش DFT و MP2 در فاز گازی 40
3-8- حالت گذار…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 46
3-9- بررسی اوربیتال های HOMO و LUMO…………………………………………………………………………………………………………………………… 48
3-10- نمایش اوربیتال های HOMO و LUMO……………………………………………………………………………………………………………………….. 50
3-11- بررسی طول پیوند برای پایدارترین توتومر با یون های مختلف………………………………………………………………………………………. 52
3-12- نتیجه گیری……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 55
مراجع:………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 20
فهرست جدولها
عنوان و شماره صفحه
جدول3-12: پارامترهای انرژی توتومرهای زانتین به روش DFT در فاز گازی بر حسب (ev). 49
فهرست شکل ها
عنوان و شماره صفحه
شکل 1-1: ساختار برخی از پورینها 3
شکل 3-1 . ساختار و شماره گذاری توتومرهای زانتین… 20
شکل3-2: ساختار بهینه شده ترکیبات مورد مطالعه با روش B3LYP/6-311++G(d,p). 22
شکل 3-4: اوربیتالهای HOMO و LUMO…. 49
شکل 3-5: ساختار پایدارترین توتومر زانتین با فلزها 54
چکیده:
زانتین (7،3- دی هیدرو- پورین-6،2- دیاون)، یک باز پورین است که در بیشتر بافتها و مایعها و دیگر اندامهای زنده بدن انسان یافت میشود. خواص ویژه و منحصر به فرد زانتین و مشتقات آن از جمله خواص زیستی و دارویی آن از اهمیت بسیاری برخوردار میباشد. در بازهای پورین بیشتر در بافتهای بدن انسان یافت میشوند و آنها در نوشیدنیهایی مثل چای، قهوه و کوکا نیز وجود دارند. محاسبات تئوری بر روی توتومرهای زانتین با بهره گرفتن از GAUSSIAN 09 و Gauss-View برنامه تجسم مولکولی بر روی کامپیوترشخصی انجام شد. مطالعات بر روی ساختار توتومرها در فاز گازی و چندین حلال مورد بررسی قرار گرفت. همچنین برهمکنش ویژه توتومر با یک مولکول آب با روش تابع عاملیت دانسیته (DFT/B3LYP) با سطح پایه 6-311++G(d,p) مورد بررسی قرار گرفت. به علاوه، تغییر ممان دو قطبی در فاز گازی و اثر حلال خاص با افزایش یک مولکول آب نزدیک مرکز الکترون دوستی توتومرها، حالت گذار انتقال پروتون به وسیله یک مولکول آب بررسی شد و تغییرات NBO در اتم نیز مورد بررسی قرار گرفت. به کمک محاسبات DFT و MP2 در فاز گازی پایدارترین فرم این توتومرها بدست آمد.
واژه های کلیدی:
زانتین، توتومری، اثر حلال، تابع عاملیت دانسیته
فصل اول
مقدمه و تاریخچه
ترکیبات آلی حلقوی
ترکیبات آلی حلقوی به دو دسته هموسیکلی [1]و هتروسیکلی[2] تقسیم میشوند. حلقههای هموسیکلی فقط دارای یک نوع اتم هستند، اما حلقه های هتروسیکلی علاوه بر کربن، یک یا چند اتم غیر کربن دارند. نیتروژن، اکسیژن و گوگرد رایجترین هترواتم ها هستند [1].
اپوکسیدها (اترهای حلقوی سه عضوی)، لاکتونها (استرهای حلقوی)، و پیریدین (یک باز حلقوی)، لاکتامها (آمیدهای حلقوی) و حلالهایی از قبیل تتراهیدروفوران (یک اتر حلقوی) همگی ترکیبات هتروسیکل هستند.
واسطههای هتروسیکلی در سنتز به عنوان گروههای محافظ، استفاده روز افزونی دارند، چنین گروههایی به آسانی تولید شده و در پایان کار به آسانی خارج میگردند. اترهای تاجی نیز ترکیبات هتروسیکلی هستند. چون یکی از خواص معمولی اترها قابلیت حلال پوشی کاتیونها میباشد، بنابراین این ترکیبات دارای اهمیت ویژهای هستند، زیرا مولکولهای آنها حلقوی و حلقههایی با اندازه های خاص میباشند که میتوانند کاتیونها را در داخل حفره خود قرار دهند. ترکیبات هتروسیکلی از جمله ترکیبات آلی هستند که خواص زیستی دارند. به عنوان مثال پنی سیلین (آنتی بیوتیک)، سایمتیدین (عامل ضد زخم معده) و ساخارین (ماده شیرین کننده مواد غذایی)، همگی در شمار ترکیبات هتروسیکلی هستند [1].
تعداد صفحه : 68
قیمت :14700 تومان
بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد
و در ضمن فایل خریداری شده به ایمیل شما ارسال می شود.
پشتیبانی سایت : * serderehi@gmail.com
در صورتی که مشکلی با پرداخت آنلاین دارید می توانید مبلغ مورد نظر برای هر فایل را کارت به کارت کرده و فایل درخواستی و اطلاعات واریز را به ایمیل ما ارسال کنید تا فایل را از طریق ایمیل دریافت کنید.
14,700 تومانافزودن به سبد خرید