دانشگاه اورمیه
دانشکده علوم
گروه زیست شناسی
پایان نامه برای دریافت درجه کارشناسی ارشد
گرایش اکولوژی تاکسونومی
عنوان:
بررسی تنوع ژنتیکی جمعیتهای بلوط ایرانی(Lindl. Quercus brantii) در بخشی از منطقه زاگرس با بهره گرفتن از مارکر مولکولی SRAP
اساتید راهنما:
دکتر فاطمه رحمانی
دکتر محمد حسن جعفری صیادی
بهمن ماه 1391
(در فایل دانلودی نام نویسنده موجود است)
تکه هایی از متن پایان نامه به عنوان نمونه :
(ممکن است هنگام انتقال از فایل اصلی به داخل سایت بعضی متون به هم بریزد یا بعضی نمادها و اشکال درج نشود ولی در فایل دانلودی همه چیز مرتب و کامل است)
فهرست مطالب
عنوان صفحه
فصل اول: کلیات
- مقدمه و هدف-بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد– 2–
- گیاهشناسی تیره راش Fagaceae—- 3
- شرح تاکسونومیک جنس بلوط Quercus————— 4
1-3-1 خصوصیات تاکسونومیک گونه Quercus brantii— 5
- پراکندگی جهانی این جنس ——— 6
- پراکندگی این جنس در ایران——– 7
- شرایط اکولوژیکی—————- 8
- ترکیبات شیمیایی بلوط ———— 8
- اهمیت درمانی بلوط————— 8
- مصرف خوراکی بلوط———— 10
- اهمیت اقتصادی بلوط———— 10
- تنوع ژنتیکی-بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد– 11
1-11-1- اهمیت تنوع ژنتیکی و روشهای مختلف ارزیابی آنبلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد————– 12
- انواع نشانگرها-بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد 12
1-12-1- نشانگرهای مورفولوژیکی– 13
1-12-2- نشانگرهای بیوشیمیایی— 13
1-12-3- نشانگرهای مولکولی مبتنی بر DNA ——— 14
1-12-3-1- نشانگرهای غیر مبتنی برPCR ——- 15
1-12-3-2- نشانگرهای مبتنی برPCR ———- 16
1-12-3-2-1 نشانگرPAPD ———– 17
1-12-3-2-2 نشانگرAFLP ———— 17
1-12-3-2-3 نشانگرSSR ————- 17
1-12-3-2-4 نشانگرISSR ———— 18
1-12-3-2-5 نشانگرSRAP و مزایا و معایب آنبلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد————- 19
- کاربرد نشانگر(مارکر)هایDNA — 20
- واکنش زنجیرهای پلیمراز(PCR)—- 21
1-14-1- مراحل واکنش زنجیرهای پلیمراز————- 22
- تجزیه و تحلیل داده ها———— 24
1-15-1 دندروگرام————- 24
1-15-2 تجزیه خوشه ای——— 25
1-15-3 ضریب شباهت———- 26
1-15-4 انتخاب الگوریتم——— 26
- بررسی كارآیی الگوریتم مورد استفاده در تجزیه كلاستر—– 26
- شاخص شانون-بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد 27
- بررسی تنوع و تفاوت ژنتیکی بین جمعیتها براساس آنالیز Neiبلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد————– 27
- سابقه تحقیق-بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد– 28
1-15-1- مروری بر برخی پژوهشهای انجام شده بر روی Quercus brantii Lindl.———— 28
1-15-2- مروری بر برخی پژوهشهای انجام شده با بهره گرفتن از نشانگرSRAPبلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد– 28
فصل دوم: مواد و روشها
2-1- انتخاب مناطق و جمعیتها— 33
2-2- جمعآوری نمونه ها و آماده سازی آنها 34
2-3- استخراج DNA از نمونه های گیاهی- 34
2-3-1- آماده کردن نمونه ها 34
2-4- تعیین كیفیت وكمیت DNA– 37
2-5- واكنش زنجیره ای پلیمراز) (PCR– 39
2-6-1- محلول اتیدیوم بروماید- 42
2-6-3- الکتروفورز محصول PCR– 43
2-7- تجزیه و تحلیل داده ها 44
فصل سوم: نتایج و بحث
3-1پلیمورفیسم -بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد——- 46
3-2 بررسی پارامترهای اصلی تنوع ژنتیکی همه لوکوسها در جمعیتهای گونهQuercus brantii Lindl.——- 50
3-3 بررسی تنوع و تفاوت ژنتیکی بین جمعیتها براساس آنالیز Nei—- 52
3-4 شباهت و فاصله ژنتیکی بین 5 جمعیت—– 54
3-5 بحث و نتیجه گیری کلی—————- 55
3-6 پیشنهادات-بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد——– 59
منابع– 62
فهرست شکلها
شکل1- 1 پراکندگی جهانی جنس بلوط (Quercus)————- 6
شکل 1-2 پراکندگی جنس بلوط(Quercus) در ایران———— 7
شکل 1-3 نمایی از گونه Quercus brantii Lindl.———— 10
شکل 1-4 نحوه اتصال پرایمرهای forward و reverse به DNA الگوبلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد————– 20
شکل 1-5 واکنش زنجیرهای پلیمراز——— 24
شکل2- 1 جمعیتها و مناطق بررسی شده در این تحقیق———– 33
شکل2-2 نمونههای برگ تازه در آزمایشگاه—– 34
شکل 2-3 دستگاه اسپکتروفتومتر برای تعیین کمیت DNA——– 38
شکل 2-4 دستگاه ترموسایکلر————- 41
شکل 2-5 دستگاه الکتروفورز عمودی——– 42
شکل 2-6 ساختار اتیدیوم برماید———– 42
شکل 2-7 دستگاه ژل داک—————- 43
شکل 3-1 الگوی باندی پرایمر————– 46
شکل 3-2 دندروگرام ژنوتیپ های مورد بررسی– 55
فهرست جداول:
جدول 2-1 اسامی جمعیتها و مناطق بررسی شده در این تحقیق—- 33
جدول 2-2 مواد استفاده شده در PCR—— 39
جدول 2-3 برنامهPCR -بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد 40
جدول 2-4 پرایمرهای مورداستفاده در آزمایش- 40
جدول 3-1 نتایج کدگذاری آغازگر Me2-Em2 برای همهی جمعیتهابلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد————– 47
جدول 3-2 نتایج چندشکلی پرایمرهای استفاده شده در این تحقیق— 49
جدول 3-3 پارامترهای تنوع ژنتیکی همه لوکوسها در کل نمونهها بر اساس مارکر SRAPبلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد———- 51
جدول 3-4 شاخص های تنوع بین جمعیتی HT، HS، GST و Nem در جمعیتهای Q. brantii————— 53
جدول 3-5 جدول ماتریس تشابه بدست آمده برای نشانگر SRAP در بین جمعیتهابلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد—– 54
چکیده
بلوط (Quercus) یکی از مهمترین جنسهای چوبی نیمکره شمالی است. این جنس از اصلیترین گونه های درختی ایران به شمار میرود. تاکسونومی و ارتباط تکاملی جمعیتهای بلوط ایرانی بر اساس مارکرهای مولکولی به طور گستردهای مطالعه نشده است. در این مطالعه، ارتباط ژنتیکی جمعیتهای بلوط با به کارگیری مارکر SRAP امتحان شد. پنج جمعیت بلوط از مناطق مختلف زاگرس شامل یاسوج، برمدشت، بیستون، آبدانان و خوزستان جمعآوری و آنالیز شدند. یازده جفت پرایمر SRAP در کل نمونهها 32 باند از 100 تا 400bp ایجاد کردند. 27 تا از این باندها پلیمورف بودند و درصد پلیمورفیسم38/84% به دست آمد. ضریب تشابه نی محاسبه شد و دندروگرام بر اساس UPGMA از روی داده های SRAP ترسیم شد. داده های SRAP با به کارگیری نرمافزار popgene در چهار خوشه دستهبندی شد. آنالیز ژنتیکی دامنه تشابه ژنتیکی بین جمعیتی نسبتاً بالا از حداقل 8818/0 بین یاسوج و برمدشت تا حداکثر 9587/0 بین بیستون و آبدانان را نشان داد. جمعیتهای مطالعه شده بلوط تنوع بالایی را نشان دادند: شمار آلل موثر 46/1 بود و شاخص تنوع ژنتیکی شانون (I) به طور متوسط 69/41% بود. جمعیتهای امتحان شده اختلاف ژنتیکی بین جمعیتی نسبتاً بالایی را (2/0 GST=) نشان دادند و جریان ژنی(Nem) 96/1 بود.
واژه های کلیدی: بلوط، تنوع ژنتیکی، مارکر مولکولی SRAP، نی، پلیمورفیسم
فصل اول:
کلیات
1–1 مقدمه و هدف
بلوط (Quercus) از تیره راش (Fagaceae) یکی از متنوعترین جنسهای درختان نواحی معتدل با بیش از 500 گونه در سراسر جهان است(61). بلوط جزء گیاهان پهن برگ است و اساساً این جنس بومی نیمکره شمالی میباشد و شامل گونه های خزانپذیر و همیشهسبز میباشد که در عرضهای جغرافیایی مختلف آسیا و آمریکا گسترده شدهاست (15). از زمان داروین بلوط به عنوان یک جنس مدل برای مطالعه فرایندهای تکاملی و گونهزایی به کار میرود، سازگاری بالا و مراحل مختلفی از جریان ژنی بین گونهای به طور معنیداری در پیدایش صدها گونه و زیرگونه و اکوتیپهای متعدد مشارکت داشتهاست(21). از یک طرف این انعطافپذیری فنوتیپی و تنوع ژنی باعث موفقیت این جنس در گونهزایی شدهاست و از طرف دیگر این خاصیت مشکلاتی را در تخمین تنوع ژنتیکی بین گونه ها و ساختار ژنتیکی جمعیتها و ارتباط تاکسونومیکی بین گونه ها ایجاد کردهاست که باید به طریقی این مشکل رفع شود(30). یکی از علل عمده این تنوع ژنتیکی در بلوط فراوانی تبادل ژنی و دخول بین گونه های جنس بلوط هیبریداسیون میباشد(24).
در حال حاضر با فشار ناشی از تخریب و بهره برداری از جنگلها توسط انسان، تغییرات اقلیم و پدیده گرم شدن کره زمین پیش بینی می شود، طی 50 تا 100 سال آینده جمعیت بسیاری از گونه های گیاهی در رویشگاههای کنونی ضعیف و ضعیفتر شده (3) و آینده جنگلهای بلوط را با مخاطرات جدی مواجه سازد. همچنین وجود مشکلاتی نظیر کمبود درختان مادری، تناوب سال بذردهی، آفات و امراض، تولید دانه ناکافی و نامناسب، ضعف دانهزادی و عدم نگهداری دانهها برای مدت طولانی (63)، روند احیاء طبیعی جنگلها را از طریق بذر با مشکل روبرو کردهاست. تدوین برنامه حفاظت از منابع ژنتیکی بلوط و توسعه و احیاء جنگلهای آن از طریق بذرکاری و نهالکاری می تواند از جمله مهمترین و اصولیترین اقدامات احیایی و حفاظتی رویشگاههای این جنس باشد. بطورکلی گزارشات موجود نشان میدهد که در بسیاری از موارد به دلیل ناسازگاری ژنتیکی نهالهای کاشته شده با شرایط محیطی(15)، نرخ پایین زندهمانی آنها(51)، باید توسط بذر ژنوتیپهایی جنگلکاری شود که با شرایط اقلیمی دوره های آینده سازگاری داشته باشد. با این وجود تنظیم و اجرای برنامه های حفاظت از منابع ژنتیکی و جنگلکاری با بذر ژنوتیپهای سازگار با استرسهای احتمالی نیازمند کسب اطلاع از تنوع ژنتیکی بین و درون جمعیتها است(53).
علاوه بر اهمیت اکولوژیکی بلوط، این جنس دارای مصارف دارویی، خوراکی و صنعتی فراوان نیز میباشد(28). این جنس یکی از مهمترین گیاهان چوبی تشکیلدهنده جنگلهای بلوط غرب محسوب می شود ولی به دلیل دور شدن این جنگلها از حالت کلیماکس و کاهش قابل توجه گونه های جنگلی تعیین تنوع ژنتیکی و حفاظت ذخایر آنها ضروری به نظر میرسد(23).
مطالعات قبلی مدارک فراوانی را مبنی بر تنوع بینگونهای براساس کاراکترهای فنوتیپی فراهم کرده اند تنوع در این جنس براساس ویژگیهای بیولوژیک، مورفولوژیک و فنولوژیک شناسایی و شرح داده شده است، به خصوص مورفولوژی برگ در این مورد مفید است و ساختار جمعیت بلوطها بر اساس ویژگی مورفولوژیکی برگ مطالعه شده است (61 و 21). تاکنون مطالعه روی تنوع ژنتیکی درون گونهای بلوط ایرانی در مناطق مختلف ایران با بهره گرفتن از مارکر SRAP صورت نگرفته است.
مارکرهای مولکولی مهمترین و کاربردیترین سیستمهای مارکری هستند که گستردگی زیادی داشته و هر روزه در حال توسعه و تکامل هستند، و از آنجا که در اولین سطح از بیان ژن مطرح می شوند خیلی دقیق بوده و دارای تنوع زیاد و پلی مورفیسم بالا هستند (15). در بین نشانگرهای مولکولی ریزماهوارهها به دلیل توانمندیهای ویژهای که در شناسایی تنوع ژنتیکی ارقام و گونه های مختلف درختان دارند از کارایی بالایی برخوردارند. هدف از کار حاضر ارزیابی امکان بکارگیری مارکر SRAP در مطالعات ژنتیکی درونگونهای بلوط و مطالعات ژنتیک جمعیت و سنجش تنوع ژنتیکی در جمعیتهای مختلف این گونه و تخمین ساختار ژنتیکی و اختلاف بین جمعیتها در قسمتهای مختلف قلمرو آن در جنگلهای زاگرس است که امید میرود کمکی در جهت طبقه بندی این جنس و بهنژادی این گیاه در آینده باشد.
تعداد صفحه : 81
قیمت :14700 تومان
بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد
و در ضمن فایل خریداری شده به ایمیل شما ارسال می شود.
پشتیبانی سایت : * serderehi@gmail.com
در صورتی که مشکلی با پرداخت آنلاین دارید می توانید مبلغ مورد نظر برای هر فایل را کارت به کارت کرده و فایل درخواستی و اطلاعات واریز را به ایمیل ما ارسال کنید تا فایل را از طریق ایمیل دریافت کنید.
14,700 تومانافزودن به سبد خرید