دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
دانشکده علوم زراعی
گروه زراعت و اصلاح نباتات
پایان نامه دوره کارشناسی ارشد در رشته مهندسی کشاورزی گرایش بیوتکنولوژی
موضوع:
مطالعه ژنتیکی و نقشه یابی ژن رنگ پایه ساقه با بهره گرفتن از نشانگرهای مولکولی ریزماهواره (SSR) در برنج
اساتید راهنما:
دکتر غلامعلی رنجبر
دکتر قربانعلی نعمت زاده
استاد مشاور:
دکتر غفار کیانی
شهریور 1389
(در فایل دانلودی نام نویسنده موجود است)
تکه هایی از متن پایان نامه به عنوان نمونه :
(ممکن است هنگام انتقال از فایل اصلی به داخل سایت بعضی متون به هم بریزد یا بعضی نمادها و اشکال درج نشود ولی در فایل دانلودی همه چیز مرتب و کامل است)
چکیده:
وجود رنگدانه های آنتوسیانین در برنج عامل اصلی تولید پایه ساقه ارغوانی رنگ محـسوب می شود. رنگ پایه ساقه در برنج رابطه مستقیم و قوی با تشکیل دانه های رنگی در برنج دارد که در زیر پوسته آنها به دلیل تراکم متفاوت رنگیزههای آنتوسیانین در لایه های مختلف پریکارپ، پوشش دانه و آلورون، رنگهای سرخ، ارغوانی و سیاه مشاهده می شود. به منظور درک درست از مسیر بیوسنتزی آنتوسیانین که اطلاعات مفیدی را در زمینه بیولوژی مولکولی و ژنتیک برنج به همراه خواهد داشت، الگوی تفرق ژن رنگ پایه ساقه با بهره گرفتن از تعداد 123 تک بوته از جمعیتF2 حاصل از تلاقی 18-33 – DN و ندا مورد مطالعه قرار گرفت. ارزیابی تک بوته های F2 بر اساس رنگ پایه ساقه نشان داد تعداد 83 بوته رنگی (ارغوانی) و تعداد 40 بوته بیرنگ تولید شده نسبت تفرق 1 :075/2 را ایجاد می نماید. آماره c2 این نسبت تفرق برابر 48/3 بود که از نسبت تفکیک 3:1 اختلاف معنی داری را نشان نداد (95/0p < ). در نتیجه ثابت شد که صفت مورد نظر از سیستم کنترل تک ژنی تبعیت می نماید. مطالعات انجام شده با بهره گرفتن از 59 نشانگر مولکولی میکروساتلیت میزان 28 درصد چند شکلی بین والدین را نشان داد و آنالیز پیوستگی روی تک بوته های مغلوب جمعیت F2 از تلاقی ندا × 18-33 – DNثابت کرد که ژن رنگ پایه ساقه بر روی بازوی کوتاه کروموزوم شماره 6 برنج با نشانگرRM253 که در فاصله 15 سانتی مورگان از ژن قرار دارد همبسته می باشد.
واژه های كلیدی:
برنج، رنگ ساقه، نشانگرهای SSR.
فهرست مطالب
عنوان صفحه
فصل اول
1-3- متابولیتهای ثانویه درگیاهان.. 3
2-1- مشخصات گیاهشناسی برنج.. 7
2-3- مهندسی تولید متابولیتهای ثانویه درگیاهان.. 8
2-4- ژنهای مسئول بیوسنتز فلاوونوئیدها و آنتوسیانینها 9
2-6- نشانگرها در برنامه های اصلاحی.. 12
2-6-2-1- نشانگرهای موفولوژیکی.. 13
2-6-2-2- نشانگرهای سیتوژنتیکی.. 13
2-6-2-3- نشانگرهای بیوشیمیایی.. 14
2-6-2-4- نشانگرهای مولکولی.. 14
2-6-2-4-1- نشانگرهای مولکولی مبتنی بر DNA 15
2-6-2-4-1-1- نشانگرهای مولکولی مبتنی بر هیبریداسیون.. 15
2-6-2-4-1-2- نشانگرهای مولکولی مبتنی بر واکنش زنجیرهای پلیمراز 16
2-6-2-4-1-3- نشانگرهای مولکولی مبتنی بر PCR و هیبریداسیون.. 16
2-6-2-4-1-4- نشانگرهای مبتنی بر توالییابی (SNPها) و تراشه DNA.. 17
2-7- کاربرد نشانگرهای مولکولی.. 17
2-8- انتخاب میان انواع مختلف نشانگرها 19
2-9- کاربرد نشانگرهای مولکولی در برنج.. 19
2-10- انتخاب به کمک نشانگرها 21
2-11- استفاده از نشانگرهای مولکولی درتهیه نقشه ژنتیکی.. 21
2-12-1- تشخیص آللهای ریزماهواره 24
2-12-2- مزایای نشانگرهای ریزماهواره 24
2-12-3- مشکلات کار با ریزماهواره 25
2-12-3-1- اشتباهات آلل خوانی.. 25
2-12-3-3- اندازه نمونه مورد نیاز 26
2-12-4- ریزماهوارهها درگیاهان و برنج.. 27
2-12-5- کاربردهای ریزماهواره 28
2-13- نقشههای پیوستگی ژنتیکی.. 28
2-15- سابقه نقشه یابی صفت رنگ دربرنج.. 30
2-15-1- ارتباط بین رنگ پریکارپ وصفت گلوتیوز 33
2-15-2- توارث رنگ نوک دانه و ارتباط آن با صفات دیگر. 33
2-15-3- روابط بین رنگ کلاله با صفات دیگر. 34
2-15-4- ارتباطات بین رنگ پوشبرگ و صفات دیگر. 34
2-15-5- ارتباط بین رنگ کلاله و رنگ پوشبرگ… 35
2-15-6- ارتباط بین رنگ زبانک با صفات دیگر. 35
2-15-7- ارتباطات بین رنگ زبانک و رنگ پریکارپ.. 35
2-15-8- نشاندار کردن ژنهای مهم اقتصادی و انتخاب به کمک نشانگر (همراه) 36
2-15-9- مطالعه ژنتیکی و نشاندارکردن ژن صفت رنگ در برنج.. 37
3-6- بررسی کمیت و کیفیت DNA استخراج شده 49
3-6-1- ازطریق اسپکتروفتومتر. 49
3-6-2- به وسیله الکتروفورز ژل آگارز 49
3-7- بارگذاری نمونه ها و اجرای الکتروفورز 50
3-8- آماده سازی آغازگرهای ریزماهواره 51
4-3- ارزیابی نشانگر RM253 در ارقام دیگر برنج.. 64
لیست پرایمرهای بکار رفته در پژوهش…. 79
ماتریس داده های مولکولی و فنوتیپی.. 83
فهرست شکلها
عنوان صفحه
شکل 3-2. والد 18-13-DN با پایه ساقه سبز رنگ…. 42
شکل 3-4. والد ندا با پایه ساقه ارغوانی رنگ…. 43
شکل3-5. عملیات نمونه برداری از نمونه های برگی برنج دو هفته پس از نشاء. 44
شکل 3-6. پودر کردن نمونه های برگی با بهره گرفتن از ازت مایع.. 46
شکل 3-7. سانتریفیوژ کردن نمونه ها 47
شکل 3-8. تشکیل سه فاز مشخص پس از افزودن کلروفرم و جدا نمودن فاز رویی.. 47
شکل 3-9. تشکیل کلاف DNA پس از مصرف ایزوپروپانول.. 48
شکل 3-10. افزودن TE به رسوب DNA و نگهداری آنها در فریزر 20-. 48
شکل 3-11 . بارگذاری نمونه ها در ژل آگارز. 51
شکل3-12 . نمونه هایی ازDNA ژنومی که به روشCTAB استخراج شده است. 52
شکل 4-1. الگوی نواربندی بین والدین مورد مطالعه با تعدادی از نشانگرهایSSR مورد مطالعه. 60
شکل 4-2. الگوی نوار بندی بین والدین مورد مطالعه با تعدادی از نشانگرهای SSR مورد مطالعه. 60
شکل 4-7 .آنالیز ارقام دارای پایه های ارغوانی و سبز با پرایمر RM253. 65
شکل 4-8. نقشه ژنتیکی نشانگر RM253 روی بازوی کوتاه کروموزوم 6.. 66
فهرست جداول
عنوان صفحه
جدول2-1. لیست ژنهای نشاندار شده توسط مارکرهای مولکولی در برنج.. 38
جدول3-1. درجه حرارت و زمان بهینه شده در مراحل مختلف واکنش PCR.. 54
جدول3-2. مقادیر بهینه شده مواد واکنش زنجیره ای پلیمراز. 55
جدول 4-1. آماره محاسباتی c2 با درجه آزادی 1 برای صفت رنگ پایه ساقه در جمعیت F2. 57
جدول 4-2. نشانگرهای پلیمورف به کار رفته در این تحقیق.. 59
1-1- تولید کنندگان برنج
برنج پس از گندم دومین غله مهم در دنیا به حسـاب می آید و به عنوان یکی از مهمترین محصولات استراتژیک جهان از اهمیت و جایگاه ویژهای برخوردار است، نزدیک به 90 درصد سطح زیر کشت و تولید برنج متعلق به کشورهای خاور دور میباشد. بیش از نصف محصول برنج دنیا در دو کشور هند و چین تولید می شود. به طور کلی، کشورهای گرمسیری و نیمه گرمسیری برمه، تایلند، ویتنام، لائوس، اندونزی، فیلیپین، پاکستان، هند، آمریکا، ژاپن، ایتالیا، مصر، چین، برزیل، کوبا، مکزیک و استرالیا از تولیدکنندگان عمده برنج به شمار میآیند. میزان تولید برنج در تایلند، برمه، ویتنام و لائوس بیش از مصرف داخلی آنهاست و بنابراین نزدیک به 90 درصد برنج موجود در بازارهای دنیا متعلق به این 4 کشور میباشد (53).
1-2- کشت برنج در ایران
کشت برنج در ایران در نواحی شمالی و در نواحی جنوبی به ویژه خوزستان تاریخچه طولانی دارد. شواهد نشان میدهد که این محصول در این ناحیه، قرنها پیش از میلاد مسیح و در زمان هخامنشیان رواج داشته است. در ایران اسلامی نیز علی رغم دستاوردهای خوب تحقیقاتی و قریب به 600 هکتار زیر کشت برنج، متاسفانه به دلیل استفاده ناصحیح و توسعه محدود ارقام اصلاح شده و با توجه به رشد روز افزون جمعیت ایران، تولید داخلی برنج پاسخگوی نیاز مردم نیست و مقادیر قابل توجهی از خارج وارد می شود. افزایش تولید به دو روش افزیش سطح زیر کشـت و افزایش در واحد سطـح امـکانپذیر میباشد. بدلیل محدود بودن زمینهای زراعی و نیز کمبود شدید آب، بدون تردید باید تولید را در واحد سطح با بهره گرفتن از روشهای بهزراعی و بهنژادی افزایش داد. دستیابی به خودکفایی در تولید برنج و حفظ ثبات قیمت آن، از جمله اهداف مهم در کشورهای کم درآمدی است که برنج بعنوان تنها غذای اصلی، اساس تأمین نیازهای غذایی بوده و برای مردم فقیر و آسیب پذیر این کشورها شغل و درآمد ایجاد می نماید(53).
تعداد صفحه : 100
قیمت :14700 تومان
بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد
و در ضمن فایل خریداری شده به ایمیل شما ارسال می شود.
پشتیبانی سایت : * parsavahedi.t@gmail.com
در صورتی که مشکلی با پرداخت آنلاین دارید می توانید مبلغ مورد نظر برای هر فایل را کارت به کارت کرده و فایل درخواستی و اطلاعات واریز را به ایمیل ما ارسال کنید تا فایل را از طریق ایمیل دریافت کنید.
14,700 تومانافزودن به سبد خرید