دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
دانشکده شیلات و محیط زیست
پایان نامه جهت اخذ درجه کارشناسی ارشد در رشته
شیلات، گرایش بوم شناسی آبزیان شیلاتی
بررسی تنوع ژنتیکی شگماهی خزری–Alosa braschnikowi broodine,1904– در سواحل جنوبی دریای خزر با بهره گرفتن از نشانگر ریزماهواره
استاد راهنما:
دکتر علی شعبانی
استاد مشاور:
دکتر حامد کلنگی میاندره
تابستان1393
(در فایل دانلودی نام نویسنده موجود است)
تکه هایی از متن پایان نامه به عنوان نمونه :
(ممکن است هنگام انتقال از فایل اصلی به داخل سایت بعضی متون به هم بریزد یا بعضی نمادها و اشکال درج نشود ولی در فایل دانلودی همه چیز مرتب و کامل است)
چکیده
شگماهی براشنیکووی (Alosa braschnikowi) یکی از گونه های بومی ماهیان استخوانی حاضر در دریای خزر میباشد که از فراوانی و پراکنش نسبتا بالایی برخوردار است و در سطوح پایین هرم اکولوژیک قراردارد. علیرغم اهمیت اکولوژیکی بالای شگماهیان، هیچگونه اطلاعاتی از ژنتیک جمعیت اعضای جنس Alosa در دریای خزر وجود ندارد. لذا تحقیق حاضر با هدف بررسی تنوع ژنتیکی شگماهی خزری (A. braschnikowi) با استفادهاز شش جفت نشانگر ریزماهواره (AsaD030، AsaD042، AsaC051، AsaC059، AsaD312 و AsaD392) در سواحل جنوبی دریای خزر صورتپذیرفت. جهت انجام این تحقیق تعداد 140 عدد ماهی از گونه مورد نظر در پنج منطقه انزلی، گمیشان، محمودآباد، میانکاله و ساری با بهره گرفتن از صید پره نمونه برداری شد (هر منطقه 28 عدد) و استخراج DNA بااستفاده از بافت باله دمی صورت گرفت. تمامی جایگاههای ژنی مورد استفاده در این مطالعه به خوبی حالت پلی مورفیسمینشان دادند. نتایج حاصل از بررسی تنوع ژنتیکی این ماهی نشان داد که میزان متوسط هتروزیگوسیتی مشاهده شده 568/0 بود که مقدار متوسط آن در مناطق انزلی، گمیشان، محمودآباد، میانکاله و ساری به ترتیب 524/0، 518/0، 637/0، 500/0 و 661/0 بهدست آمد. شاخص غنای آللی برای مناطق مورد بررسی 63/12 بهدست آمد. بررسی تعادل هاردی واینبرگ در جمعیتها میزان انحراف بالایی را از تعادل در سطح جایگاهها نشان داد و از بین 30 حالت ممکن (شش جایگاه × پنج جمعیت)، 29 حالت از تعادل خارج بودند و انحراف معنیداری نشان دادند. (05/0P<). میانگین جریان ژنی و ضریب درون آمیزی محاسبه شده بین مناطق به ترتیب 31/9 و 349/0 بود. نتایج حاصل از آنالیز واریانس مولکولی براساس شاخص Fst تنوع ژنتیکی درون مناطق را بالا (96%) و میزان تمایز بین مناطق را نسبتا پایین (4%) نشان داد ولی شاخص Rst توانست تنوع ژنتیکی بالاتری را بین مناطق (40 درصد) نمایش دهد. نتایج بهدستآمده در این مطالعه نشاندهنده غنای آللی نسبتاً مناسب این گونه بوده ولی احتمال در تنگنا قرارگرفتن در آینده بهخاطر ویژگی گلهای بودن آن وجود دارد. بهنظر میرسد احیای زیستگاهها و جلوگیری از صید ناخواسته بیرویه این گونه می تواند در بالا نگهداشتن اندازه جمعیت مؤثر آن مفید واقع شود.
واژگان کلیدی: آلل،تنوع ژنتیکی، دریای خزر، ژنتیک جمعیت، نشانگر ریزماهواره، Alosa braschnikowi
فهرست مطالب
عنوان صفحه
10-1- تنوع ژنتیکی و کمی کردن آن. 6
11-1- عوامل مؤثر بر تنوع ژنتیکی.. 6
12-1- انواع نشانگرهای ژنتیکی.. 8
1-12-1- نشانگرهای مورفولوژیکی.. 9
2-12-1- نشانگرهای پروتئینی.. 9
3-12-1- نشانگرهای مولکولی DNA و RNA.. 10
15-1- موازنه هاردی- واینبرگ و دلایل انحراف از آن. 14
فهرست مطالب
عنوان صفحه
17-1- فاصله ژنتیکی (Nei, 1978) 17
1-2- مروری بر مطالعات انجام شده در داخل کشور. 22
2-2- مروری بر مطالعات انجام شده در خارج از کشور. 24
5-3- ارزیابی کیفیت و کمیت DNA استخراج شده 34
6-3- ارزیابی کیفیت DNA با بهره گرفتن از الکتروفورز افقی ژل آگارز یک درصد. 36
7-3- واکنش زنجیرهای پلیمراز. 37
1-7-3- انجام واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) 37
9-3- الکتروفورز محصول PCR، با بهره گرفتن از ژل پلی آکریل آمید 6%. 38
10-3- روش تهیه ژل آكریل آمید. 39
11-3- رنگ آمیزی ژل پلی آکریل آمید با روش نیترات نقره 40
فهرست مطالب
عنوان صفحه
4- نتایج.. 44
1-4- نتایج حاصل از بررسی کیفیت و کمیت DNA استخراجی از شگماهی براشنیکوی در مطالعه حاضر 44
2-4- نتایج حاصل از واکنش زنجیرهای پلیمراز. 45
3-4- فراوانی و تعداد آللها 47
4-4- تعداد آللهای واقعی (Na) و مؤثر (Ne) 50
8-4- نتایج آزمون واریانس مولکولی (AMOVA) 54
9-4- شباهت و فاصله ژنتیکی بر اساس شاخص نئی (Nei Index) 56
5- بحث… 60
1-5- مطالعات تعداد نمونه، روش استخراج DNA و انتخاب نشانگرها 60
3-5- مطالعات مربوط به تعادل هاردی- واینبرگ… 65
4-5- مطالعات مربوط به تمایز جمعیتی.. 67
5-5- مطالعات مربوط به شباهت و فاصله ژنتیکی.. 68
فهرست منابع. 72
فهرست جدولها
عنوان صفحه
جدول 1-4- جایگاههای ژنی مورد استفاده در این مطالعه و خصوصیات آنها 45
جدول 2-4- نتایج حاصل از ظرفیت اطلاعات چند شکلی (PIC) نشانگرهای مورد استفاده در مطالعه حاضر 45
جدول 4-4- فراوانی آللی مشاهده شده در سطح جایگاههای ژنی مورد مطالعه در این تحقیق.. 49
جدول 9-4-مقادیر محاسبه شده در بررسی تعادل هاردی- واینبرگ در مناطق مورد بررسی در شش جایگاه ژنی 53
جدول 10-4- آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA) تحت معیار Fst 54
جدول 11-4- آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA) تحت معیار Rst 54
جدول 12-4- مقادیر Fst محاسبه شده بین مناطق بر اساس آنالیز واریانس مولکولی.. 55
جدول 13-4- مقادیر Rst محاسبه شده بین مناطق بر اساس آنالیز واریانس مولکولی.. 55
فهرست جدولها
عنوان صفحه
جدول 15-4- مقادیـر جریـان ژنـی (Nm) مشـاهده شـده بین مناطـق مورد بررسی در ماهی A. braschnikowi 56
جدول 16-4- ماتریکس فاصله و شباهت ژنتیکی بر اساس شاخص نئی (نئی، 1972) 56
جدول 17-4- خلاصهای از نتایج تخصیص جمعیتها به خود و دیگر مناطق.. 57
فهرست شكلها
عنوان صفحه
شکل 1-3- نقشه مناطق نمونه برداری ماهی A. braschnikowi در سواحل جنوبی دریای خزر در مطالعه حاضر 30
شکل 2-3- تصویر بیوفتومتر مورد استفاده در مطالعه حاضر. 35
شکل 3-3- تصویر دستگاه الكتروفورز افقی.. 37
شکل 4-3- تصویری از دستگاه الكتروفورز عمودی مورد استفاده در مطالعه حاضر. 39
شکل 5-3- تصویری از دستگاه مستند ساز ژل. 41
شکل 1-4- تصویری از ژل آگارز یک درصد و باندهای تشکیل شده از DNA بر روی آن. 44
شکل 8-4- نمودار گرافیکی جدایی مناطق مورد بررسی در مطالعه حاضر. 57
مقدمه
1-1- كلیات
دریای خزر باقیمانده دریای تتیس، به عنوان بزرگترین دریاچه جهان تعداد زیادی از گونه های آبزی را در خود جای داده است و حفظ این گونه ها به پایداری این اکوسیستم کمک شایانی می نماید. تنوع ژنتیکی به عنوان یکی از سه سطح تنوع زیستی، بهعنوان پایهای و کلیدیترین بخش در سلسله مراتب تنوع نقش ایفا می کند. یکی از خانواده های مهم ماهیان در دریای خزر، خانوده شگ ماهیان (Clupeidae) است که به فراوانی در سرتاسر دریای خزر پراکنش یافته است (پاتیمار و همکاران، 2013). این خانواده در دریای خزر شامل دو جنس بوده که از جنسهای معروف آن میتوان به جنس Alosa با بیشتر از چهار گونه در آبهای دریای خزر اشاره کرد (عبدلی و نادری، 2008). شگماهی براشنیکووی (Alosa braschnikowi Borodin, 1904) از جمله ماهیان استخوانی حاضر در این دریاست که از تراکم و پراکنش نسبتاً مناسبی برخوردار است و بومی این دریا محسوب می شود و معمولاً در صیدهای پره به عنوان صید ضمنی مشاهده میگردد ولی در خارج از فصل صید پره با بهره گرفتن از تورهای گوشگیر نیز صید می شود. شگماهیان بطور عمده پلانکتونخوار بوده و نقش مهمی را در هرم اکولوژیک اکوسیستم دریای خزر به عنوان بزرگترین دریاچه جهان بازی می کند (عبدلی و نادری، 2008).
تعداد صفحه : 103
قیمت :14700 تومان
بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد
و در ضمن فایل خریداری شده به ایمیل شما ارسال می شود.
پشتیبانی سایت : * parsavahedi.t@gmail.com
در صورتی که مشکلی با پرداخت آنلاین دارید می توانید مبلغ مورد نظر برای هر فایل را کارت به کارت کرده و فایل درخواستی و اطلاعات واریز را به ایمیل ما ارسال کنید تا فایل را از طریق ایمیل دریافت کنید.
*
14,700 تومانافزودن به سبد خرید